Creado en el 2008, el programa “Monitoreo y Evaluación de la Biodiversidad” se desarrolla sobre la base de una colaboración entre la empresa Peru LNG y el Centro de Conservación, Educación y Sustentabilidad del Smithsonian Conservation Biology Institute, a fin de integrar la conservación de la biodiversidad dentro de la instalación y operación del gasoducto de la empresa y las operaciones en la planta y en el terminal portuario de Melchorita (Pisco). Lo que se busca es entender el estado y las tendencias ecológicas de las especies y los hábitats de la zona, evaluar la eficacia de los esfuerzos de mitigación y proponer recomendaciones de manejo y contribuir al conocimiento de la biodiversidad de la región, su manejo y conservación, además de contar con los reportes continuos de monitoreo. Es así que el programa genera información de especies y hábitats de conservación especial para satisfacer la meta que se han propuesto ambas instituciones respecto de la integración y la conservación de la biodiversidad dentro del desarrollo y operación de la empresa. Además, esta información se emplea para elaborar monitoreos biológicos que provean de guías para la toma de decisiones que contribuyan a mitigar posibles impactos del proyecto en la biodiversidad. El programa cuenta hoy con protocolos de investigación y conservación prácticos y aplicables a proyectos similares. También se ha difundido información generada por el proyecto a las partes interesadas, incluyendo la comunidad científica, al mismo tiempo que se ha provisto de estrategias para la capacitación adecuada de investigadores y gerentes de los diversos departamentos involucrados. En lo que va del programa se ha determinado seis comunidades biológicas y 12 especies de interés que han sido evaluados en 18 protocolos de investigación. Para este trabajo se ha contado con la participación de más de 70 investigadores en 42 expediciones en tierra a lo largo de la ruta del gasoducto y seis expediciones en el mar.